Миссия Тигирекского заповедника – обеспечение устойчивого гармоничного взаимодействия человека и природы.

Цель создания заповедника: включение в заповедную сеть России и мира эталонных природных систем – типичной для Западного Алтая черневой тайги, горной лесостепи и других ландшафтов среднегорий, сохранение их биологического разнообразия и экологической структуры.

Задачи заповедника:

1. Охрана природных территорий в целях сохранения биологического разнообразия и поддержания в естественном состоянии охраняемых природных комплексов и объектов.
2. Организация и проведение научных исследований, включая ведение Летописи природы.
3. Экологический мониторинг процессов и явлений в природных системах.
4. Экологическое просвещение.
5. Формирование у населения бережного отношения к природе.
6. Участие в государственной экологической экспертизе проектов и схем размещения хозяйственных и иных объектов.
7. Содействие в подготовке научных кадров и специалистов в области охраны окружающей природной среды.
8. Содействие развитию сетей особо охраняемых природных территорий в Алтайском крае и РФ.
9. Создание условий для неистощительного использования природных ресурсов.